Aufgewachsen im Bergischen Land zwischen Köln und Düsseldorf, erhielt Jan Donner zunächst Klavierunterricht, bevor er die Instrumente der Posaunenfamilie für sich entdeckte. Sein Studium der Posaune bildete die Grundlage für eine international ausgerichtete Laufbahn als Orchestermusiker, Solist und Pädagoge.

Jan Donner war Wechselposaunist im Orchester der Deutschen Oper Berlin und ist als Gast in zahlreichen renommierten deutschen und internationalen Klangkörpern tätig. Zu einer Auswahl der Orchester, mit denen er zusammenarbeitete, gehören das Gewandhausorchester Leipzig, das Deutsche Symphonie-Orchester Berlin, das Gürzenich-Orchester Köln, die Staatskapelle Berlin, die Staatskapelle Dresden, das Mahler Chamber Orchestra, die Hamburgische Staatsoper sowie die Düsseldorfer Symphoniker.

Als Solist konzertierte er unter anderem mit der Polnischen Kammerphilharmonie, den Bergischen Symphonikern, der Jungen Bläserphilharmonie NRW sowie dem Musikkorps der Bundeswehr.

Darüber hinaus war er Gründungsmitglied des Blechbläserensembles 10forBrass. An der HFM Dresden ist er Mitinitiator und Organisator des brassSpektrum Festivals, das künstlerische Impulse setzt und den Austausch im Bereich Blechbläser auf internationaler Ebene bündelt.

Jan Donner ist regelmäßig Gast bei internationalen Festivals und Konzertreihen, unter anderem beim International Trombone Festival, und gibt Meisterkurse weltweit, unter anderem in den USA, China usw. 

Im Jahr 2021 erschien seine Debüt-CD Meanwhile. Im April 2025 veröffentlichte er die CD Layers, eine Produktion in Zusammenarbeit mit dem Musikkorps der Bundeswehr.

Neben seiner künstlerischen Tätigkeit gilt sein besonderes Engagement der Ausbildung des musikalischen Nachwuchses. Von 2018 bis 2023 war er Lehrbeauftragter an der Hochschule für Musik und Theater Rostock. Seit 2019 unterrichtet er am Bach-Gymnasium Berlin, einer Spezialschule für hochbegabten Orchesternachwuchs. Im Oktober 2022 wurde er zum Professor für Posaune an der Hochschule für Musik Carl Maria von Weber Dresden berufen. Im November 2024 wurde er dort mit dem Lehrpreis ausgezeichnet.

Ergänzend zu seiner musikalischen Laufbahn absolvierte Jan Donner qualifizierte Weiterbildungen in den Bereichen Kirchenmusik (C-Ausbildung Orgel), Musikphysiologie sowie Mentales Training, die seine künstlerische und pädagogische Arbeit substantiell unterstützen.